L’errore di Stoner, terzo nel Gran Premio del Giappone, permette a Jorge Lorenzo di rosicchiare 4 punti in classifica mondiale. Il vantaggio dell’australiano è comunque ancora cospicuo, 40 punti quando mancano solo 3 gare al termine della stagione 2011. La vittoria a Motegi è andata a Dani Pedrosa che in classifica tallona ad una sola lunghezza il terzo posto occupato da Andrea Dovizioso (195 contro i 196 punti del forlivese). Torna a casa senza punti Valentino Rossi caduto dopo le prime curve di GP.
In classifica marche la Honda comanda con 355 punti seguita da Yamaha a 294. Staccate Ducati e Suzuki.
CLASSIFICA PILOTI
| Pos. | Pilota | Team | Pt. |
| 1. |  STONER | HONDA | 300 |
| 2. |  LORENZO | YAMAHA | 260 |
| 3. |  DOVIZIOSO | HONDA | 196 |
| 4. | PEDROSA | HONDA | 195 |
| 5. |  SPIES | YAMAHA | 156 |
| 6. | ROSSI | DUCATI | 139 |
| 7. | HAYDEN | DUCATI | 123 |
| 8. | SIMONCELLI | HONDA | 119 |
| 9. | EDWARDS | YAMAHA | 98 |
| 10. |  AOYAMA | HONDA | 94 |
| 11. | BARBERA | DUCATI | 77 |
| 12. | BAUTISTA | SUZUKI | 67 |
| 13. |  CRUTCHLOW | YAMAHA | 57 |
| 14. |  ABRAHAM | DUCATI | 50 |
| 15. | ELIAS | HONDA | 47 |
| 16. |  DE PUNIET | DUCATI | 39 |
| 17. | CAPIROSSI | DUCATI | 29 |
| 18. | AKIYOSHI | HONDA | 7 |
| 19. | HOPKINS | SUZUKI | 6 |
| 20. | ITO | HONDA | 3 |
CLASSIFICA COSTRUTTORI
| Pos. | Team | Pt. |
| 1. | HONDA | 355 |
| 2. | YAMAHA | 294 |
| 3. | DUCATI | 162 |
| 4. | SUZUKI | 73 |